Ein "Supermutt" enthüllt seine geheime Identität

Der beste Weg, einen Hund zu bekommen, ist im Allgemeinen, einen zu retten. Das bedeutet oft, einen Köter zu adoptieren, dessen Freuden zu zahlreich sind, um sie aufzulisten. Viele Köter haben jedoch auch eine trübe Herkunft, die möglicherweise rassenspezifische Bedürfnisse, Macken oder Gesundheitsrisiken in ihrer DNA verbirgt.

Vor fünf Jahren schrieb ich über zwei Hunde-DNA-Tests, die ich für meinen Rettungsköter Otis gekauft hatte. Die Ergebnisse waren interessant und unterhaltsam, wenn auch ein wenig Licht auf den praktischen Wert. Ich nahm sie mit einem Körnchen Salz, war aber froh, zumindest einen kleinen Einblick zu bekommen.

Wie ich damals erwähnte, waren kommerzielle Hunde-DNA-Tests 2012 noch ziemlich neu. Ich wollte irgendwann ein Follow-up zu diesem Blog-Beitrag schreiben, und dann kontaktierte mich ein in Texas ansässiges Startup namens Embark, um die neuen zu überprüfen Prüfung.

Mein vorheriger Beitrag enthielt Tests, die von BioPet Vet und Wisdom Panel verkauft wurden, aber ich werde sie hier nicht erneut überprüfen. BioPet Vet ist nicht mehr auf dem Markt, und obwohl Wisdom Panel eine neuere Version hat, wollte ich nicht erneut für einen Test bezahlen, der sich möglicherweise nur geringfügig von dem unterscheidet, den Otis bereits durchgeführt hat. Und ehrlich gesagt hätte ich Embark vielleicht noch nicht ausprobiert, wenn sie mir keinen kostenlosen Test geschickt hätten. Ich denke, es ist im Nachhinein ein gutes Geschäft - ja, sogar bei 200 Dollar - aber wie ich weiter unten erläutern werde, hängt es davon ab, wonach Sie suchen.

Ein harter Köter zum Knacken

Otis als Welpe. (Foto: Russell McLendon)

Lassen Sie mich zunächst kurz Otis vorstellen. Wir haben ihn 2010 als monatelangen "Husky Mix" aus dem Tierheim adoptiert. Wir sahen wenig Grund, dies zu bezweifeln, da er ein Welpe war und bereits einige Anzeichen von Huskiness hatte wie ein buschiger, lockiger Schwanz.

Das genaue Make-up der Rasse war uns auch nicht wirklich wichtig. Unsere Neugier wuchs jedoch, als Otis älter wurde, da dieser angebliche Husky ziemlich klein blieb. Angesichts der Tatsache, wie viel Bewegung ein Husky im Vergleich zu vielen anderen Rassen benötigen würde, beschlossen wir, tiefer zu graben.

Ich werde nicht auf diese früheren Ergebnisse eingehen, aber es reicht zu sagen, dass sie nicht genau übereinstimmten. Keiner der Tests berichtete über ein Husky-Erbe, und die einzige von beiden aufgeführte Rasse war Mops. BioPet Vet listete auch Pekingese, Beagle und Bulldogge auf, während Wisdom Panel einen detaillierteren Stammbaum hatte, der australischen Rinderhund, Chow-Chow und Corgi enthielt.

Dann, vor ein paar Monaten, kontaktierte mich Embark auf Twitter, um mich zu fragen, ob ich daran interessiert wäre, ihren Test auf Otis auszuprobieren. Ich sagte, ich sei es, also schickten sie mir ein kostenloses Kit.

Was ist Einschiffung?

Otis versenkt seine Zähne in DNA-Tests. (Foto: Russell McLendon)

Embark wurde von zwei Brüdern, Ryan und Adam Boyko, gegründet, die mit Rettungshunden aufgewachsen sind. Ryan ist Informatiker und Adam ist Professor für Biomedizin an der Cornell University, wo er sich auf die genomische Untersuchung von Hunden konzentriert. Sie gründeten Embark im Jahr 2015 und brachten im Mai 2016 ihr erstes Produkt auf den Markt.

"Eine Sache, die wir in unserer Forschung festgestellt haben, ist, dass viele Menschen ihren Hund an den Studien teilnehmen lassen wollten", sagt Adam Boyko gegenüber Site. "Weil sie es für cool hielten und einen Beitrag zur Forschung leisten wollten, aber auch, weil sie etwas über ihren eigenen Hund wissen wollten. Da wir immer mehr machten, begannen wir mit dem Brainstorming und kamen auf die Idee, auf dem neuesten Stand zu sein Forschung DNA-Tests für Hunde von Menschen, die sich sehr von den einmaligen DNA-Tests unterscheiden. Dieser Weg ist kleiner und billiger, aber weniger umfassend und treibt die Wissenschaft überhaupt nicht voran. "

Embark ist ein kommerzielles Produkt, das jedoch aus einer wissenschaftlichen Suche hervorgegangen ist: die Identifizierung genetischer Marker für Krankheiten bei Hunden, die letztendlich sowohl der Gesundheit von Hunden als auch von Menschen zugute kommen könnten. Und durch Crowd-Sourcing-DNA von Kötern, um ihren Rassenmix zu enthüllen, kann Embark die Neugier seiner Kunden befriedigen und gleichzeitig massenhaft Gesundheitsdaten sammeln. Es ähnelt dem Modell "Freizeitgenomik" von 23andMe, ist jedoch für Hunde geeignet.

"Wir sind dabei, Hunde gesünder zu machen", sagt Boyko, "und eine schöne Ergänzung dazu ist, dass wir Dinge wie Abstammung betrachten können."

Tupfergeschichte

Was auch immer er sonst ist, Otis ist ein Vollblut-Sofahund. (Foto: Russell McLendon)

Als das Embark-Kit per Post einging, wurde ein vertrauter Vorgang beschrieben: Tupferwangenzellen - und unweigerlich sabbern - aus Otis 'Mund, sichern Sie den Tupfer in einem Behälter und versenden Sie ihn zur Analyse. (Das Kit enthält detailliertere Anweisungen, die Sie in diesem Video sehen können.) Im Gegensatz zu den früheren Tests wurde mir auch gesagt, dass ich online ein Konto erstellen soll.

Es dauerte einige Wochen, bis die Ergebnisse vorliegen. Als sie endlich ankamen, erhielt ich nicht nur ein einziges Dokument per Post oder E-Mail - ich loggte mich in mein Embark-Konto ein und befand mich in farbenfrohen Informationen.

Mit diesem Konto kann ich im Laufe der Zeit einen Blick darauf werfen, wie die Forschung neue Erkenntnisse für Otis enthüllt. Embark wird mich auch informieren, wenn neue Funktionen und Ergebnisse verfügbar sind. In der Zwischenzeit gibt es einen öffentlichen Link, über den Sie die Ergebnisse von Otis teilen können. Embark bietet separate Datenschutzeinstellungen für Rassen-, Gesundheits- und Merkmalsdaten, aber ich habe gerade alle Informationen von Otis veröffentlicht. (Entschuldigung, Kumpel!) Hier können Sie sein vollständiges Embark-Profil sehen.

Rasse zwischen den Linien

Hier ist die erste Aufschlüsselung der Rassen. Es enthält einige Überschneidungen mit dem Wisdom Panel, nämlich Mops, Chow und australischer Rinderhund. Der höchste Prozentsatz geht jedoch an "Supermutt", was Embarks Art ist, genetische Ambiguität anzuerkennen:

Abgesehen von "Supermutt" sind die Top-Rassenergebnisse für Otis Labor, Mops und Chow. (Bild: Einschiffung)

"Einige Hunde stammen von anderen Hunden ab, die selbst Mischlinge waren", erklärt Embarks Website das Supermutt-Label. "Diese anderen Hunde können kleine Beiträge zur Abstammung Ihres Hundes leisten, so klein, dass sie nicht mehr als eine bestimmte Rasse erkennbar sind."

Wie Sie oben sehen können, gab es dennoch genügend Hinweise, um drei mögliche Mitglieder des Supermutt-Teils zu identifizieren: Basset Hound, Boston Terrier und Coonhound. "Wenn wir auf die letzten drei Generationen zurückblicken, können wir sehen, dass es kein Urgroßelternteil ist", sagt Boyko, "aber wir sehen definitiv Marker von einer Rasse, also setzen wir das dort ein." Die meisten Hunde haben nur einen geringen Prozentsatz an Supermutt, fügt er hinzu.

Den Stammbaum bellen

Wie Wisdom Panel hat Embark auch einen Stammbaum mit detaillierteren Informationen zu Otis 'Supermutt-Wurzeln erstellt. Es ist nicht seine einzig mögliche Abstammung, aber Embark sagt: "Unsere Algorithmen sagen voraus, dass dies der wahrscheinlichste Stammbaum ist, der Otis 'Rassenmix erklärt."

Ein möglicher Stammbaum für Otis mit freundlicher Genehmigung von Embark. (Bild: Einschiffung)

Trotz der offensichtlichen Unterschiede weist dieser Stammbaum überraschende Ähnlichkeiten mit dem von Wisdom Panel auf. Beide enthalten zum Beispiel nicht nur Mops und Chow in Otis 'Vorfahren, sondern beide enthalten auch eine Mops- und eine Chow-Mischung als wahrscheinliche Großeltern. Der australische Rinderhund erscheint auch auf beiden, wenn auch als Vollgroßeltern im Wisdom Panel und nur als Teil eines Urgroßelternteils in Embark.

Es könnte nur die Kraft der Suggestion sein, aber ich kann Hinweise auf all diese Rassen in Otis sehen. Er hat den Schwanz, den Oberkörper und den Appetit eines Mops, die Sportlichkeit eines Retrievers oder eines Boxers und vielleicht sogar ein wenig Unabhängigkeit eines Chows. Und angesichts der Art und Weise, wie er mich zum Essen oder zu Fuß durch das Haus treibt, zweifle ich nicht an dem Viehhund.

In DNA graben

Wie Otis bestätigen kann, ist es nicht einfach, mit dem Graben aufzuhören, wenn Sie erst einmal angefangen haben. (Foto: Russell McLendon)

Die Schlüssel zu einem Test wie Embark sind genetische Marker, die die genetische Basis von vererbten Merkmalen aufdecken können, die von Haarfarbe bis zu Gesundheitsrisiken reichen. Die Forscher verwenden ein Tool namens DNA-Microarray, um genetische Variationen zwischen Individuen zu finden, einschließlich Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs, ausgesprochen "Snips").

Frühe Rassetests stützten sich auf nur 30 oder 40 Marker, was sie für viele Hunde sinnlos machte, aber sie sind in letzter Zeit genauer geworden. Das Wisdom Panel umfasst mittlerweile fast 2.000 Marker, während Embark mehr als 200.000 Marker verwendet, basierend auf seiner eigenen internen Forschung. "Meines Wissens verwenden wir keine der gleichen Marker", sagt Boyko und fügt hinzu, dass die Algorithmen der Unternehmen auch "völlig unterschiedlich" sind.

Die Menge der Marker ist jedoch nicht alles, bemerkt Urs Giger, Leiter des klinischen Programms für Veterinärgenetik an der University of Pennsylvania. Die Genauigkeit eines Tests hängt "sehr davon ab, wie viele Hunde sie getestet haben, um den Algorithmus zu ermitteln, mit dem die richtigen Antworten gefunden werden können", sagt er. "Wenn Leute sagen, dass sie 2.000 oder 200.000 SNPs verwenden, ist die Frage, wie viele dieser SNPs wirklich informativ sind, um zwischen der einen oder anderen Rasse, Krankheitsmerkmalen usw. zu unterscheiden."

Embark und Wisdom Panel sind nicht perfekt, aber laut Jerold Bell, Professor für klinische Genetik an der Tufts University, heben sie sich durch ihre Forschung von den meisten US-Konkurrenten ab. "Ich würde mich an diese beiden Unternehmen halten, weil sie zuverlässig sind", sagt er, "und weil sie in der Lage sind, Fragen zu beantworten und Fragen zu ihren Testergebnissen weiter zu untersuchen."

Krank wie ein Hund

Otis trägt nach einer Krebsoperation im Jahr 2016 einen Schamkegel. (Foto: Russell McLendon)

Die Erforschung des Erbes eines Köter wie Otis mag interessant sein, aber für viele Tierärzte spielen Hunde-DNA-Tests eine weitaus wertvollere Rolle.

"Ich denke, Tiergesundheit ist wichtiger als Rasse und Abstammung", sagt Giger, dessen Labor seit 25 Jahren Erbkrankheitstests an Hunden durchführt. Bell stimmt zu, da das Wissen, dass ein Hund einen bestimmten genetischen Marker hat, "vorbeugende Maßnahmen ermöglichen könnte, die das Auftreten von Krankheiten minimieren oder beseitigen". Das Testen auf Rasse und Abstammung hingegen erscheint ihm als "eher eine Neuheit für den Besitzer".

Trotz der hohen Genauigkeit waren die Krankheitstests laut Giger bis vor kurzem viel enger und teurer. "Es ist sehr aufregend, diese SNP-Chip-Proben analysieren zu lassen und nicht nur für einen Krankheitstest, sondern für mehrere Krankheitstests sowie für die Zusammensetzung und Herkunft der Rassen zum gleichen Preis auf kostengünstige Weise verfügbar zu sein."

Gesundheitsergebnisse sind ein Verkaufsargument für Embark, und da sich meine älteren Tests nicht mit Gesundheit befassten, war ich fasziniert, diesen Teil von Otis 'Profil zu sehen. (Wisdom Panel 2.0 ist immer noch nur für Rassen verfügbar, aber neuere Versionen testen auf eine geringe Anzahl von Krankheitsmutationen. Für mehr als das benötigen Sie die Veterinär- oder Züchtertests des Unternehmens.)

Alles klar, irgendwie

Wie der Rest seines Berichts ist auch der Gesundheitsbereich voller Informationen. Wie die folgende Zusammenfassung jedoch deutlich macht, waren die Ergebnisse von Otis so positiv wie möglich:

Ein Screenshot von Otis 'Gesundheitsübersicht von Embark. (Bild: Einschiffung)

Embark testet derzeit auf etwa 160 Erbkrankheiten, und Otis testete auf ganzer Linie. Das ist nicht ungewöhnlich, erklärt Boyko. Etwa die Hälfte der Hunde, die sie bisher getestet haben, erzielen dieses Ergebnis, und etwa ein Drittel ist Träger für einige Krankheiten.

Dies sind zwar willkommene Neuigkeiten über Otis, aber noch nicht schlüssig. "Kein Hund und kein Mensch ist genetisch perfekt", sagt Giger. "Jeder Hund kann einige schädliche Mutationen aufweisen, die dazu führen können, dass einige Personen eine Krankheit aufweisen." Otis ist anfällig für krebsartige Mastzelltumoren, von denen einige in den letzten Jahren operativ entfernt werden mussten. Embark hat noch nicht genug Daten, um dies zu testen, aber sie arbeiten daran - und weitere Hinweise von Hunden wie Otis sollten helfen.

"Mastzelltumoren sind ein aktives Forschungsgebiet", sagt Boyko. "Wir haben Hunderte und Hunderte von Fällen von Mastzelltumoren gesammelt, auch Kontrollen, und wir hoffen, dass wir durch Gesundheitsumfragen bei Embark mehr Fälle von Mastzellen mit genetischen Informationen erhalten. Und mit größeren Stichproben, denke ich, wir Ich werde anfangen, das zu identifizieren. "

"Füllen Sie also unbedingt die Gesundheitsumfrage für Otis aus", fügt er hinzu. (Ich habe es getan.) "Das war einer der Hauptgründe, warum wir Embark bauen wollten, weil wir damit Marker für alle möglichen Dinge identifizieren. Als Akademiker gibt es wirklich keinen guten Weg, um ein Forschungsstipendium zu erhalten, das sich auszahlt." zum Testen von Tausenden und Abertausenden von Hunden. "

Wie bei DNA-Tests beim Menschen besteht jedoch die Gefahr von Fehlinterpretationen. Ein Marker für eine Krankheit zu haben, bedeutet nicht unbedingt, dass ein Hund zum Beispiel krank wird, und einige Mutationen, die eine bestimmte Rasse krank machen, "können tatsächlich eine andere Darstellung in einer anderen Rasse verursachen", sagt Giger. "Sie können bei einer Rasse Krankheiten verursachen und bei einer anderen keine Krankheit oder mildere Krankheitsmanifestation." (In diesem Sinne könnte die Rassenmischung eines Köter mehr als nur eine Frage der Neugier sein.)

Um das Risiko von Verwechslungen zu verringern, vermeidet Embark medizinische Beratung, stellt Online-Ressourcen zur Verfügung, um die Ergebnisse ins rechte Licht zu rücken, und ermutigt Kunden, einen Tierarzt zu konsultieren. Genetische Beratung ist ein wesentlicher Bestandteil von Gentests, sagt Giger, obwohl sowohl er als auch Bell feststellen, dass einige Tierärzte möglicherweise nicht gut genug versiert sind, um solche Unterstützung anzubieten.

Wer hat Angst vor dem kleinen, guten Wolf?

Otis erwägt, seiner Ernährung mehr Meeresfrüchte hinzuzufügen. (Foto: Russell McLendon)

Die Ergebnisse von Otis bieten auch einige andere interessante Statistiken, wie das vorhergesagte Erwachsenengewicht (49 Pfund), das genetische Alter (57 Menschenjahre) und die "Wolfigkeit" (0, 6 Prozent):

"Der Wolfiness Score basiert auf Hunderten von Markern im gesamten Genom, bei denen Hunde (oder fast alle) gleich sind, Wölfe jedoch tendenziell unterschiedlich sind", erklärt Embark. "Es wird angenommen, dass diese Marker mit 'Domestikationsgen-Sweeps' zusammenhängen, bei denen frühe Hunde nach bestimmten Merkmalen ausgewählt wurden." Die meisten Hunde haben jetzt Wolfswerte von 1 Prozent oder weniger, aber einige "besonders einzigartige Individuen" erreichen 5 Prozent oder mehr.

Das vorhergesagte Gewicht ist eines der wenigen Ergebnisse, die ich überprüfen kann, und es ist genau richtig. Das könnte eine glückliche Vermutung sein, aber Boyko sagt, dass diese Schätzungen nicht so locker sind, wie Sie vielleicht denken.

"Wenn wir uns die Körpergröße und andere Faktoren ansehen, können wir das Kalenderalter eines Hundes tatsächlich in ein dem Menschen gleichwertiges Alter umwandeln, um zu sehen, wo sich dieser Hund im Lebenszyklus befindet", sagt er. "Und vom Standpunkt eines Genetikers aus gibt es so viel, was man aus seiner DNA vorhersagen kann, viel mehr als bei Menschen. Es gibt einige Gene, die für die Körpergröße kodieren, also schauen wir uns die 18 verschiedenen Gene an und können basierend darauf vorhersagen Die Größe des Hundes sollte mit einer Genauigkeit von 80 bis 90 Prozent sein. Das ist viel höher als beim Menschen. "

Warum ist die Körpergröße bei Hunden leichter vorherzusagen? "Wegen der Art und Weise, wie wir Hunde gezüchtet haben", erklärt Boyko. "Nur wenige Gene machen den größten Teil dieses Unterschieds aus, während es bei Menschen viele kleine Varianten im gesamten Genom gibt."

Trotz der vielen Unterschiede zwischen der DNA von Hunden und Menschen, so Boyko, könnten die Big Data von Embark umfassende genetische Erkenntnisse bieten, die für beide Arten relevant sind.

"Sie haben vielleicht Hunde, die einen genetischen Marker haben, aber niemals die genetische Krankheit entwickeln. Gibt es also irgendwo in ihrem Genom eine kompensatorische Mutation, die sie daran hindert, diese Krankheit zu bekommen?" er sagt. "Das ist auch für die menschliche Gesundheit von großer Bedeutung, da Menschen einige der gleichen Krankheiten bekommen können, die Hunde haben. Neben Menschen haben Hunde mehr bekannte genetische Krankheiten als jedes andere Tier - und von den genetischen Krankheiten, die Hunde haben, haben fast alle analoge Menschen Störungen. "

Viel zu kauen

Otis hat ein Problem mit der Idee, dass seine "Wolfigkeit" nur 0, 6 Prozent beträgt. (Foto: Russell McLendon)

Ich habe immer noch nicht alle Informationen behandelt, die Embark über Otis enthüllt hat. Es gibt zwei Abschnitte über die Abstammung, die zum Beispiel sowohl seine mütterliche als auch seine väterliche Abstammung darstellen. Es gibt eine Liste von Mutationen für Merkmale wie Fellfarbe, Gesichtszüge, Schnauzenlänge und Schuppen. Es gibt eine farbcodierte Karte der Rassenmischung nach Chromosomen. Ein Teil seines Profils ist auch mit Fotos anderer Hunde gefüllt, "die einen oder mehrere Rassenprozentsätze ähnlich wie Otis haben", mit Links zu den Embark-Profilen dieser Hunde.

Schließlich, sagt Boyko, könnte Embark sogar helfen, Hunde wieder mit ihren Wurfgeschwistern zu verbinden - vorausgesetzt, sie haben alle Embark-Profile. "So etwas wie ein relativer Finder kann man mit Gentechnologie sicher machen", sagt er. "Daran arbeiten wir eigentlich, aber wir haben es noch nicht eingeführt."

Es gibt auch mehr Gesundheits- und Merkmalsergebnisse in der Entwicklung, fügt er hinzu, "sowie andere Dinge, die wir nicht vorhersagen können, weil die Forschung noch nicht durchgeführt wurde."

Embark soll eine langfristige Beziehung sein, die ihre Ergebnisse und Dienstleistungen im Laufe der Zeit aktualisiert, ähnlich wie es 23andMe für Menschen tut. Es kostet 200 US-Dollar, was mehr ist als die vergleichbaren Verbrauchertests von Wisdom Panel, bietet aber im Gegenzug auch mehr Details.

Unabhängig davon, für welchen DNA-Test Sie sich entscheiden, nehmen Sie an der personalisierten Zukunft des Gesundheitswesens für Hunde teil, sowohl für Hunde als auch für Menschen. "Die Fähigkeit, in einem Panel-Test auf mehrere Krankheitsgene zu testen, ist sehr wichtig", sagt er. "Da sich solche Panel-Tests (wie beim Menschen) weiterentwickeln, werden sie zu einem wichtigen Bestandteil der Krankengeschichte und des medizinischen Managements des Hundes . "

Otis ist derweil selig ahnungslos. Während ich über seine genetischen Marker für Fellfarbe und Schnauzenlänge nachdenke, schnarcht er laut vom Sofa aus.

Es ist schon komisch, so viel über Otis 'DNA zu wissen, zumal er nicht einmal weiß, was DNA ist. Trotzdem bin ich froh, all diese Erkenntnisse zu haben - sowohl weil es letztendlich der Gesundheit des Hundes im Allgemeinen zugute kommen könnte, als auch weil es mich bereits daran erinnert hat, wie glücklich ich bin, diese seltsame Kreatur zu kennen, die auf meiner Couch schläft.

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